Madagaskars tropisches Küstenklima wird bestimmt durch den Südäquatorialstrom. Im gemäßigten Klima des Hochlandes im Landesinneren kann es kühl werden, aber an den Küsten ist es ganzjährig heiß. Im Jahresmittel liegen die Temperaturen bei 25 °C. Die Regenzeit von Mai bis September ist unterschiedlich ausgeprägt in den verschiedenen Landesteilen. An der am Indischen Ozean gelegenen Ostküste sowie an der Nordküste regnet es in dieser Periode viel, während es an der Westküste nur relativ wenige Niederschläge zu verzeichnen gibt. Auch der Süden des Landes bleibt ganzjährig sehr trocken.

Das Hochland von Madagaskar hat ein angenehmes Klima. Von Oktober bis April liegen die Temperaturen im Durchschnitt bei angenehmen 20 °C und steigen nur selten über 30 °C. Von Mai bis September kann es nachts durchaus frieren, es bleibt allerdings weitgehend niederschlagsfrei.

Die besten Reisezeiten auf Madagaskar sind regional unterschiedlich. Der Süden des Landes kann ganzjährig besucht werden, denn es regnet nur sehr selten. Für die Nord- und Ostküste empfiehlt sich die Zeit von Mai bis Oktober. Das Hochland lässt sich am besten im Frühjahr und im Herbst erkunden. Während dieser Zeit fallen die wenigsten Niederschläge und die Temperaturen bleiben in einem angenehmen Bereich.